Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms