Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB5P09067 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXB5P09067 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms