Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRCP08575 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRCP08575 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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