Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSP90AB1P08238 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HSP90AB1P08238 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HSP90AB1P08238 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HSP90AB1P08238 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HSP90AB1P08238 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 626 ms