Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSLP07711 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSLP07711 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSLP07711 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms