Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPBP07199 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPBP07199 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPBP07199 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPBP07199 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPBP07199 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPBP07199 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPBP07199 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPBP07199 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPBP07199 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPBP07199 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPBP07199 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPBP07199 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPBP07199 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPBP07199 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPBP07199 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPBP07199 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPBP07199 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPBP07199 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPBP07199 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPBP07199 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPBP07199 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPBP07199 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPBP07199 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPBP07199 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPBP07199 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPBP07199 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPBP07199 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBP07199 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBP07199 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBP07199 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBP07199 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBP07199 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBP07199 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBP07199 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBP07199 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBP07199 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBP07199 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBP07199 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBP07199 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBP07199 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBP07199 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBP07199 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBP07199 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBP07199 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBP07199 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPBP07199 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPBP07199 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPBP07199 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms