Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms