Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYF2O95926 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYF2O95926 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYF2O95926 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYF2O95926 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYF2O95926 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYF2O95926 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYF2O95926 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SYF2O95926 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYF2O95926 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms