Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG7O95352 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG7O95352 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG7O95352 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms