Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms