Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSVO60911 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSVO60911 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTSVO60911 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTSVO60911 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTSVO60911 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTSVO60911 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTSVO60911 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSVO60911 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSVO60911 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSVO60911 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSVO60911 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSVO60911 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSVO60911 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSVO60911 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSVO60911 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSVO60911 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSVO60911 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSVO60911 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSVO60911 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSVO60911 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSVO60911 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSVO60911 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSVO60911 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSVO60911 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSVO60911 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSVO60911 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSVO60911 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms