Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NOBOXO60393 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms