Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CREB3O43889 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CREB3O43889 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms