Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms