Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HTATSF1O43719 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms