Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRTM2O43300 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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