Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLOCKO15516 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms