Protein–RNA interactions for Protein: O15315

RAD51B, DNA repair protein RAD51 homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51BO15315 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD51BO15315 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAD51BO15315 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAD51BO15315 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAD51BO15315 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAD51BO15315 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAD51BO15315 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAD51BO15315 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAD51BO15315 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51BO15315 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms