Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms