Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRDCB7Z8K6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms