Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CYSRT1A8MQ03 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms