Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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