Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDR42E2A6NKP2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms