Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERINC4A6NH21 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms