Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP17L4A6NCW7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms