Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EFCAB5A4FU69 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFCAB5A4FU69 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms