Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms