Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IGHV3-16A0A0C4DH30 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IGHV3-16A0A0C4DH30 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IGHV3-16A0A0C4DH30 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IGHV3-16A0A0C4DH30 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IGHV3-16A0A0C4DH30 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IGHV3-16A0A0C4DH30 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IGHV3-16A0A0C4DH30 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IGHV3-16A0A0C4DH30 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IGHV3-16A0A0C4DH30 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
IGHV3-16A0A0C4DH30 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IGHV3-16A0A0C4DH30 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms