Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms