Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF330Q9Y3S2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms