Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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HCN4Q9Y3Q4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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HCN4Q9Y3Q4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HCN4Q9Y3Q4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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