Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP3Q9Y3E7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms