Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMC3Q9UQE7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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