Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms