Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FZD4Q9ULV1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms