Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN1Q9ULB1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms