Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHIC2Q9UKJ5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms