Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW8

ZNF180, Zinc finger protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF180Q9UJW8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF180Q9UJW8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF180Q9UJW8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms