Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms