Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms