Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM5BQ9UGL1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM5BQ9UGL1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms