Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCF2Q9UG63 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCF2Q9UG63 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms