Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLKQ9UBT6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POLKQ9UBT6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms