Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
CCDC180Q9P1Z9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CCDC180Q9P1Z9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms