Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO1Q9P1Z2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO1Q9P1Z2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO1Q9P1Z2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO1Q9P1Z2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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