Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HMG20BQ9P0W2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms