Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms