Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TOR4AQ9NXH8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms