Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms