Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LMBRD1Q9NUN5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms